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Biomasse microbienne dans les sols

En complément aux analyses de sol, notamment le statut acido-basique et la teneur en matière organique, l’analyse de la biomasse microbienne est une bonne indication de la santé et du potentiel de fertilité du sol.

En effet, les microorganismes jouent un rôle majeur dans la fourniture d’éléments nutritifs et la structuration des sols. Ils participent également à la dégradation de certains polluants et à la régulation biologique.

Le carbone microbien est le carbone contenu dans les microorganismes vivants du sol. On parle également de biomasse microbienne ou de Matière organique vivante. C’est un indicateur de l’abondance de microorganismes (bactéries et champignons) dans le sol.

Cette analyse porte sur les terres agricoles et s’adresse principalement aux universités, centres recherches et autres professionnels de l’environnement. Elle s’adresse aussi aux agriculteurs désireux de mieux connaitre l’impact de leurs pratiques culturales sur la vie du sol. 

La méthode consiste à doser le carbone provenant de la lyse cellulaire des microorganismes par fumigation au chloroforme. Le résultat correspond à la différence de teneur en carbone entre un échantillon fumigé et non fumigé. Cette différence de carbone est directement proportionnelle à la quantité de microorganismes tués par le chloroforme.

Biomasse microbienne dans les sols

Quelques règles simples à respecter pour la prise d'échantillons de sols destinés à l'analyse de la biomasse microbienne.

Idéalement durant les périodes du printemps ou de l’automne. Evitez les temps secs de l’été et les gelées de l’hiver (température entre 8°C et 25°C idéalement).

Veillez à réaliser le prélèvement:

  • Avant tout épandage de produits organiques, d’enfouissement de résidus de culture ou de destruction de couvert. Si ce n’est pas possible, un délai de minimum 2 mois entre le prélèvement et le dernier apport de carbone au sol est préconisé 
  • Avant tout apport d’engrais minéral basique ou 6 mois après le dernier apport 
  • Impérativement avant labour, travail profond ou superficiel du sol et minimum 2 mois après le dernier travail du sol
  • Après valorisation de tout apport d’engrais minéral (pluie supérieure à 15-20 mm) et au moins 4 à 5 semaines après le dernier apport.

 

Déterminer des zones homogènes dans la parcelle

Réaliser 15 prélèvements en zigzag ou en croix par zone homogène ou dans une zone plus localisée, selon les objectifs de l’étude :

  • prélever à l'aide d'une sonde ou d'un plantoir (pas de bêche) enfoncée verticalement (pour respecter la proportion des horizons) ;
  • prélever à une profondeur constante (15 cm sous prairie ou pelouse, 25 cm sous culture) ;
  • éviter de prélever en bordure de parcelles, près des chemins ou dans les zones où on a stocké du fumier ou de l'amendement.

Rassembler les 15 prélèvements dans un seau :

  • homogénéiser
  • placer 200 g de terre dans un sac plastique propre
  • Identifier le sac

L’échantillon doit arriver le plus rapidement possible après le prélèvement. Il doit être conservé au frais afin de ne pas se réchauffer durant le transport.

Afin d’organiser au mieux les plannings d’analyses et pour une meilleure prise en charge des échantillons, il est demandé d’avertir le laboratoire de l’arrivée du ou des échantillons minimum 24 heures avant le prélèvement (02/656 09 70).